1. RNA sequencing 분석하기

RNA seq 가격이 떨어져서 micro array를 대체한지 어언 10년이 되었다.

이에 따라 수 많은 review 논문에서 RNA seq 분석방법이 정리되어 오고 있다.

초심자들에게 직접적인 명령어를 공유하고 빠른 분석을 하고자 이번 글을 쓰게 되었다.

앞으로 부지런히 bioinformatic blog를 정리하여 올리도록 하겠다.

이번에 올릴 분석 방법은 illumina paired-end sample을 대상으로 작성되었다.

(왜냐하면 요새 국내 NGS 데이터 생산 vendor 사에서 100 bp paired end로 100 M reads의 total RNA seq을 주로 서비스 하기 때문이다.)

우선 해당 사항은 10.1038/s41576-019-0150-2 을 기반으로 쓰여지게 되었다. 

가장 흔한 방법으로 설명하도록 하겠다.