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2.2. FASTQ의 QA (Quality Assessment) 진행하기Bioinformatics solution/NGS GATK HaplotypeCaller 2018. 9. 4. 17:16728x90반응형SMALL
모든 작업은 재현 가능해야 한다.
현대 산업화에서 가장 중요한 것은 균일한 품질을 갖는 상품이다.
이러한 균질하고 재현가능한 결과를 얻기 위해서는 품질 평가가 필요하다.
이러한 품질 평가단계로 FASTQ 에서는 FASTQC라는 프로그램을 이용하게 된다.
Quality Assessment 는 매우 중요하다.
https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/
다운 받아서 설치하자.
설치 방법은 매우 단순하다.
준비물 fastq 파일 준비
fastqc [sample fastq]
해당 실행은 매우 쉽다. 결과로
결과를 보는게 중요할 뿐이다.
이것은 추후 업로드 하겠다.
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